梅艳芳于1990年生日会公开宣布退出竞夺音乐奖项（其后所获均为音乐致敬荣誉）。1991年初梅艳芳在推出自己的首张国语专辑《亲密爱人》后决定暂别舞台，并举行了“告别舞台演唱会”，共开30场，挥泪告别歌迷，场面感人。
1994年，梅艳芳推出唱片《是这样的》，至此，梅艳芳过往专辑销量累计突破一千万张。此后，她又一连推出了《镜花水月》、《女人花》、《床前明月光》等专辑，形象依然突破多变，歌曲风格多样。其中《女人花》和《一生爱你千百回》等歌曲成为梅艳芳国语歌的代表。“中国风”歌曲《床前明月光》则是她在新领域的一次尝试，配合她的演绎，充盈着浓厚的文艺气息。
1995年，梅艳芳首次开启内地巡回演唱会，梅艳芳耐不住歌迷的热情，尾场临时加唱禁歌《坏女孩》，虽遇歌词敏感处以“啦啦啦”带过，仍被认定违规，其余场次被迫取消，梅艳芳自此遭遇内地“七年封杀”，失去了在内地举行个人演唱会的资格。
1998年梅艳芳获得香港乐坛最高荣誉“金针奖”。1999年初，梅艳芳受邀至中央电视台春节联欢晚会表演。
进入新世纪后，梅艳芳不再活跃一线，却更加积极致力于内地香港演艺事业的交流合作以及提携后辈。2002年为纪念加盟乐坛20周年，梅艳芳倾力制作音乐大碟《with》，当中收录她与11位好友合唱的歌曲。当年的香港十大劲歌金曲颁奖礼六位女歌手（郑秀文、杨千嬅、容祖儿、 何韵诗、 梁咏琪、陈慧琳）合唱《似水流年》致敬。同年举行纪念入行的世界巡回演唱会（极梦幻演唱会），由于当年内地解禁，梅艳芳提出在京沪两地开唱的请求，最终只获准上海一场，亦成为梅艳芳人生中唯一一场粤语地区以外的内地演唱会。